| 연구목표 |
TCR (T cell receptor) 과 pMHC (peptide-MHC complex) 의 서열 및 구조 데이터를 기반으로 TCR과 pMHC 사이의 결합 여부를 예측하는 기계학습모델을 개발하고자 함. 특히 알고리즘 학습 과정에서 접하지 않은 새로운 펩타이드(unseen peptide) 에 대해서도 정확도가 높은 모델을 개발하는 것을 목표로 함. 예측모델... |
| 연구내용 |
□ 서열 기반 TCR-pMHC 결합 예측 모델 개발 (1년차)- 심층 단백질 언어 모델을 이용하여 효과적으로 TCR과 pMHC 서열의 정보를 encoding 하는 방법 연구- 전이 학습을 통해 성능이 향상된 TCR과 pMHC 간 결합 예측 모델 개발- 어텐션 메커니즘을 이용하여 TCR과 pMHC 간의 연관성을 효과적으로 모델링하는 방법 개발□ 구조 기반 T... |
| 기대효과 |
- 암 면역치료 분야, 특히 개인맞춤 암 백신 개발을 위한 신항원 예측에 매우 중요하게 활용될 것으로 예상됨. 기존의 신항원 예측 모델들에 비해, 본 연구에서 개발한 모델은 T 세포의 면역반응에 대한 예측까지도 포함하여, 기존 모델들보다 높은 예측 성능을 보일 것으로 예상됨. 모델의 성능이 입증되면 실제 임상 현장에서 암 백신 개발에 유용하게 사용될 수 있... |
| 키워드 |
TCR-pMHC 결합 예측 모델,신항원 예측,딥 러닝 모델,생물정보학 |